Static Mesh の Light Map Coordinate Index を4にしたアセットを配置してライトビルドを実行すると結果がおかしくなる

不要であればスタティックメッシュの各LOD設定の中にある"ライトマップUVを作成"のチェックを外すように設定してください。これによりライトマップUVが自動生成されなくなるはずです。