同一メッシュ内での半透明マテリアルのソートは、どの様な順番になるのでしょうか？
自作のメッシュで、半透明越しに半透明を見ると、奥の方が手前に表示される箇所があります。（UE4.6.1）
例えば、標準の椅子メッシュのマテリアルを半透明にすると添付画像の様になります。
これは、opacitiy が 1 なのでソート順関係なく不透明時と同じになるかと思いましたが、構成パーツ毎のソートに見えます。
同一メッシュ内のソートは、メッシュのエレメント順に描画されます。エレメント番号が小さいほど先に描画される順番です
オブジェクト単位でのソート順のコントロールに関してはご存知と思われますが、念のためドキュメントへのリンクもご紹介させていただきます。
また、4.7よりプロジェクト設定にて、オブジェクト単位のソート時に、カメラからの距離（デフォルト）、カメラ座標の奥行き、座標軸の3種類から選択できるように拡張されています。