マテリアルのUsed with Geometry Collectionsが落ちた状態でアセットがクックされている可能性があります。
一度当該マテリアルの再セーブをお試しください。
このようにパッケージビルドでデフォルトマテリアルにフォールバックして表示されている場合、以下の様なログが出力されている可能性があります。
LogMaterial: Warning: Material /Game/Materials/M_XYZ.M_XYZ missing bUsedWithGeometryCollections=True! Default Material will be used in game. LogMaterial: Warning: The material will recompile every editor launch until resaved.こちらが出ていないかご確認いただけますでしょうか。