参考リンクありがとうございます。 下記画像のように「Substance」プラグインを無効にし、かつエディタ、ランチャーを再起動することで正常にパッケージ化することができるようになりました。また、今回LeapMotionは使わないので不要だと思われるLeapMotionプラグインを無効にしていると、パッケージ化してできたexeファイルを実行したときに、LeapMotionプラグインがない旨のダイアログが表示されましたので、これは無効にしない方が良さそうでした。
