プロジェクトを軽量化して持っていきたい

根本的な対応策は、そもそも不要なアセットを入れないことです

本番用プロジェクトとは別にアセット取得用のプロジェクトを用意し、アセットは一旦そちらに入れてから、必要なものだけMigrateすると良いでしょう

逆に、使用しているアセットだけ抽出して別のプロジェクトを作成するなら
空のプロジェクトを作成し、そちらに必要なアセットをMigrateでコピーすればよいです

C++コードやProjectSettings等はMigrateでは移動できませんが、大部分はMigrateでなんとかなるはずです