バージョンを変えるにあたりコピーしたファイルでエラーが出ており困っています。
ファイルの名前は変えるなどの対応しました
コピー元はパッケージ化できたのですが、原因は何でしょうか？
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ログを見た所おそらく「プロジェクト名の不一致」によるエラーだと思います。
コピーしたプロジェクトフォルダに
「Binaries」「DeruvedDataCache」「Intermediate」「Saved」
フォルダがある場合は該当するフォルダを削除して、.uprojectファイルの名前もプロジェクト名変更後の名前に変更してください。
この状態で再びパッケージングしてみてください。
エクスプローラー上でプロジェクトフォルダをコピーして名前を変更するという行為は危険です。
プロジェクト名はプロジェクトの至る所で関係してくるので1箇所名前を変更すると残りすべてのプロジェクト名使用箇所をチェックして修正していく必要があります。
おすすめのプロジェクト名変更方法はランチャーにあるプロジェクトのClone機能を使う方法です。
プロジェクト名を後から変更する方法については以下の記事が参考になります。