質問者さんが示している動画がどこにあるものかわかりませんので、具体的な回答はできませんが、Masterレベルシーケンスは全体の尺が変更できるのに対して、Masterレベルシーケンス内のレベルシーケンスは尺が変更できると全体の長さに問題があるため、ショートカットが無効化されているとだと思われます。(ショートカット以外のメニューからの変更も無効化されています)
結果、レベルエディター内のグリッドサイズ変更のショートカットが効くようになってしまっているのかと。これ自体はバグかもしれませんが、特に大きな問題もないため、そのままになっているのかと思います。仰るように通常のレベルシーケンスであれば反応しますが、Masterレベルシーケンスに組み込む場合は全体に影響するので、無闇に触らない方がでしょう。