スタンドアローンモードだとローカルマルチのコントローラ入力が効かない

マルチプレイヤーを実際に試したことはないですが、スタンドアローンだと通常とは動作が変わるようです。

エディタの環境設定の中に"レベルエディタ"という項目があります。
その中にある MultiPlayer Options が、スタンドアローンで実行した時の動作に関係しています。
いくつか設定項目があるので、組み合わせて試してみるのがいいと思います。