そんな方法があったとは、、、 早速実行しようと思ったのですが、GenerateProjectFiles.batが見つかりませんでした。 （ランチャーからプロジェクトを作成したから？）
GenerateProjectFiles.batで検索をかけたところ、以下のようなページを見つけました。 Not Finding GenerateProjectFiles.bat - Community & Industry Discussion - Epic Developer Community Forums
こちらの手順通りに、UnrealEngineProjectFileを右クリックしてGenerateVisualStudioprojectfilesを選択してみたら無事に初期設定に戻ったようです。
ありがとうございます。 お手数をおかけしました。