プロジェクト実行中にメッシュをフォルダから読み込む

公式のやり方ですと、良くPCゲームでありますが、パッチの仕組みが該当するかなと思います。
下記のパッチの仕組みに関しては下記のリンクをご参照ください。
(実行中にメッシュ指定の場合ですとパッチでは難しいです)

他には下記のC++で作るという方法もあります。
こちらはスクラッチする感じなので多少作成コストはかかるかなと思います。