特定の条件下で、スポーン直後のアクターのスケルタルメッシュにレベルシーケンスからアニメーションを流すと、スポーン直後だけアクターにアニメーションが流れません

>手元で試した限りにおいては StandaloneGame/Package では問題が発生しないように見受けられますが

この件についてですが、処理タイミングの関係から BP_GameInstance::Init における EnableAnimationBudget では BudgetAllocator の有効化に失敗していたようです。

仮に LevelBP の BeginPlay から行うように変更することで PIE の場合と同様の状態(1フレーム目にアニメーションが適用されていない)になります。