私はSketchUpを使用してモデリングしてtwinmotionで仕上げる工程で仕事しておりますが、質問者様の言っていることはよくわかります。 twinmotionでは面だけの着色はできない？ですから確かに作業が煩雑ですよね。 私の場合はモデリング作業の時に、適当な色を配色して（内装には青、外壁には黒等）仕上げておいてからtwinmotionへインポートしております。 モデリングの状態ではいろんな配色でとても奇抜な建物となってしまいますが（笑）twinmotionでの仕上げ作業はワリと楽？にマテリアルを変更でています。 参考になるかわかりませんが一つの案として発信しました。 他の方はどうやっているのか興味ありますね。