私自身、archicadの事はよくわからないのですが、本来こういった場合はモデリングツール側でUVの調整（テクスチャーの原点を調整など）をしてインポートするべき部分になってきます。
ですので、Twinmotion上での対処法は、今やられている通り複数マテリアルを使用するやり方になってしまうかと思います。。。
参考までにお伝えしておきますと、、、
効率がよいかはプロジェクトの複雑さ次第かとは思いますが、別のやり方としては、Pコンをオブジェクトとして取り込んで黒くしたり、デカールでPコンを表現するなどあるかとは思います。