一般的なPythonの言語評価を調べていただければ分かる話ですが、Pythonという言語は基本的に 実行速度が遅い 言語です
メインで使用することも想定されていないので、互換性重視で、最適化も特にないものと考えられます
対してC++は実行速度が非常に高速な言語です
BPはC++で作成されたビジュアルスクリプト言語で、UE4ではこれをメインで使用するため、当然最適化はしっかり入っています
UE4に同梱されているPythonを他の高速なサブセットに置き換えることができれば、実行時間自体は早くなりそうですが、互換性に問題が出てくると思われるため、あまり期待できないでしょう
いずれにしろ、そもそもが遅いPythonでBP（C++）と同等の速度を出すことは望むべくもありません