UIのアニメーションを正しいフレームレートでmp4へ出力したい

どのように実装したか不明なため詳しいことはわかりませんが、Widget、つまりUIはスローや倍速の影響を受けないもののため、シーケンサ上で時間拡張を行っている場合は映像と同期しない可能性があります。

時間拡張により伸びた分を考慮したUIのアニメーションにするのが一つの手段です。

また、MP4に書き出すことが前提であれば等速で撮影し編集ソフトでスローを入れるのがいいと思われます。