こんにちは、yyyaaaさん
自分の環境でUE4.16でライティングビルドを行ったところ正常にビルド出来たため
エンジンの不具合の可能性は低そうです。
もしかしたらSwarm Agentに上手く繋げていないことが原因になっているかもしれません。
お手数ですが、PCのファイアウォールやセキュリティソフトの設定を今一度ご確認いただけますでしょうか。
下記の質問が参考になるかもしれません。
1度目を通していただけると幸いです。
よろしくお願いします。
https://answers.unrealengine.com/questions/230786/ヒルトか機能しない何回か試しているとフレヒューの影さえ消える.html