MaterialFunctionEditorで使用されているPreview用のMaterialがBlendMode=Opaqueの設定であるため、
SceneTextureを扱えない旨のエラーが出ていることが要因と思われます。
エラーが出たとしてもMaterialFunctionとしては問題なく使用することができます。
回避方法としては、添付図のようにResultの右クリックからプレビューを切ることが挙げられます。
（プレビューが表示されなくなりますがMaterialFunctionのプレビュー結果はそこまで重要ではないです）
