出力した実行ファイルがLowLevelFatalErrorを起こしてクラッシュする

ブループリントのネイティブ化が原因かもしれないです。
ちゃんとコンパイル出来てるはずなのにエラーがでるということがあります。
その場合ネイティブ化が原因というエラーはでないので、原因不明な感じになります。
いったんネイティブ化無効でパッケージ化+動作確認してみて下さい。

具体的に何がどう悪いのかはわからないのですが、
Blueprint Nativization MethodをExclusive にすると、ちゃんと動かないことが結構ありました。
Inclusiveにして高速化が必要な部分だけ対象にした方が安定します。