モデルとモーション別々のfbxからインポートして関連づけ

仰っている関連付けの意味が今ひとつわかりません。

アニメーションのFBXが読めているのなら、アニメーションタブの中にアニメーション一覧がでてこないでしょうか?それを選択すればアニメーションが再生されます。

何かしら関連付けるという操作があるというように思っておられるのでしたら、そのような操作はありません。