Android9で動作させるだけなら、UE4.24に添付されているCodeWorks（1R7u1）で問題なくビルド可能です
手元のGalaxyS9（Android9）で動作確認しています
手持ちのAndroid9(API28)に対応していないので、
どの部分について言及されているのかわかりませんが、Android9だから、といって必ずしもそのAPIレベルに合致したSDKやNDKを必要とするわけではありません
Android9についての何らかの最新機能がどうしても必要で、そのためのネイティブコードを書いており、その実行のために必要、というのであれば話は変わってくると思いますが…
少なくとも、エラーメッセージにあるように、UE4.24のAndroidビルドにおいては対象のNDKをサポートしていません
ここを修正したいならGithubにあるソースを修正してエンジンビルドを行う必要があると思いますが、このあたりは自己責任でお願いします
なお、これは蛇足ですが、投稿時点でPreview版であるUE4.25では、CodeworksではなくAndroidStudioを用いたビルドに変わります
この環境セットアップ用のバッチファイルを確認しましたが、この中に android-28 の文字が確認できるため、期待されている環境に近いものになるのではないでしょうか