他CGソフトであるようなアルファチャンネルを持ってレンダリングをして背景を合成することをできないかと考えています。 そういったレンダリング方法の設定はTWでできるのでしょうか? できるのであれば設定を教えていただきたいです。

今のところ、そういった書き出しは出来ないかと思います。

似たようなことをやるとすれば、空を雲などをなくしてなるべくシンプルな空にしてPhotoshopなどで差し替える形になるかと思います。